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FPGA Implementation of the FM-Index String Matching algorithm

Língua InglêsInglês
Livro Capa mole
Livro FPGA Implementation of the FM-Index String Matching algorithm Edward Bryann Fernandez
Código Libristo: 06936667
Editoras Scholars' Press, novembro 2013
This book discusses the research processes of developing a hardware implementation of a string match... Descrição completa
? points 617 b
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This book discusses the research processes of developing a hardware implementation of a string matching algorithm. The first phase of the research is qualifying the appropriate algorithm for the application of DNA sequence matching. The second phase is re-inventing the algorithm to make it suitable for a hardware implementation. The third phase is implementing the chosen algorithm using FPGAs. The last phase is measuring performance using real data sets for comparison to other known tools. Our implementation shows a real time speedup up of up to 70x against BOWTIE, a known tool used in sequence matching.

Atriz & Poliglota
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Sobre o livro

Nome completo FPGA Implementation of the FM-Index String Matching algorithm
Autor Edward Bryann Fernandez
Língua Inglês
Encadernação Livro - Capa mole
Data de emissão 2013
Número de páginas 140
EAN 9783639702781
ISBN 3639702786
Código Libristo 06936667
Editoras Scholars' Press
Peso 213
Dimensões 152 x 229 x 8

Categorias

Matemática & ciência > Biologia, ciências da vida > Ciências da vida: questões gerais > Genética (não-médica)
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